Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDGFL1Q5TGJ6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms