Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC27A3Q5K4L6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms