Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC178Q5BJE1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms