Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SVEP1Q4LDE5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SVEP1Q4LDE5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms