Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP28Q4G0W2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP28Q4G0W2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms