Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms