Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms