Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LETM2Q2VYF4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
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