Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SPHKAPQ2M3C7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SPHKAPQ2M3C7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
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