Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK4Q16654 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
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