Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LAMA4Q16363 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA4Q16363 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
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