Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK4Q16099 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms