Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC85BQ15834 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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