Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ALX1Q15699 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
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