Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TWIST1Q15672 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms