Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF13Q15543 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms