Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SHPRHQ149N8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
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