Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DSC3Q14574 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC3Q14574 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms