Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNC3Q14003 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNC3Q14003 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNC3Q14003 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNC3Q14003 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNC3Q14003 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNC3Q14003 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNC3Q14003 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNC3Q14003 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNC3Q14003 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNC3Q14003 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNC3Q14003 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNC3Q14003 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNC3Q14003 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNC3Q14003 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNC3Q14003 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNC3Q14003 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNC3Q14003 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNC3Q14003 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNC3Q14003 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNC3Q14003 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNC3Q14003 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNC3Q14003 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNC3Q14003 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNC3Q14003 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNC3Q14003 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNC3Q14003 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNC3Q14003 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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KCNC3Q14003 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNC3Q14003 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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