Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRQ13535 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRQ13535 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRQ13535 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRQ13535 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRQ13535 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRQ13535 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRQ13535 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRQ13535 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRQ13535 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRQ13535 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRQ13535 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATRQ13535 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATRQ13535 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRQ13535 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRQ13535 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRQ13535 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRQ13535 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRQ13535 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRQ13535 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRQ13535 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRQ13535 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRQ13535 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRQ13535 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRQ13535 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRQ13535 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRQ13535 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRQ13535 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRQ13535 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRQ13535 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRQ13535 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRQ13535 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRQ13535 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRQ13535 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRQ13535 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRQ13535 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRQ13535 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRQ13535 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRQ13535 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRQ13535 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRQ13535 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRQ13535 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRQ13535 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRQ13535 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRQ13535 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRQ13535 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRQ13535 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRQ13535 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRQ13535 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRQ13535 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRQ13535 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRQ13535 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRQ13535 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRQ13535 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRQ13535 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRQ13535 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRQ13535 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRQ13535 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRQ13535 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRQ13535 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRQ13535 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRQ13535 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRQ13535 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRQ13535 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRQ13535 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRQ13535 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRQ13535 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRQ13535 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRQ13535 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRQ13535 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRQ13535 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRQ13535 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRQ13535 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRQ13535 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRQ13535 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRQ13535 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRQ13535 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRQ13535 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRQ13535 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRQ13535 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRQ13535 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRQ13535 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRQ13535 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRQ13535 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRQ13535 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRQ13535 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRQ13535 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRQ13535 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRQ13535 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRQ13535 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRQ13535 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRQ13535 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRQ13535 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRQ13535 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRQ13535 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRQ13535 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRQ13535 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRQ13535 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRQ13535 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRQ13535 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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