Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
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