Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCIRG1Q13488 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
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