Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF6Q13247 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms