Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRDNQ13061 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
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