Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK2Q13002 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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