Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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