Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP1Q12981 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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