Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXF2Q12947 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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