Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TROQ12816 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TROQ12816 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TROQ12816 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TROQ12816 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TROQ12816 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TROQ12816 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TROQ12816 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TROQ12816 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TROQ12816 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
TROQ12816 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TROQ12816 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
TROQ12816 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TROQ12816 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
TROQ12816 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TROQ12816 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TROQ12816 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TROQ12816 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TROQ12816 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TROQ12816 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TROQ12816 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TROQ12816 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TROQ12816 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TROQ12816 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TROQ12816 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
TROQ12816 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
TROQ12816 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TROQ12816 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TROQ12816 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TROQ12816 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TROQ12816 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TROQ12816 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TROQ12816 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TROQ12816 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TROQ12816 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TROQ12816 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TROQ12816 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TROQ12816 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TROQ12816 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TROQ12816 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TROQ12816 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TROQ12816 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TROQ12816 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TROQ12816 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TROQ12816 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TROQ12816 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TROQ12816 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TROQ12816 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TROQ12816 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TROQ12816 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TROQ12816 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TROQ12816 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TROQ12816 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TROQ12816 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TROQ12816 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TROQ12816 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
TROQ12816 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TROQ12816 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TROQ12816 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TROQ12816 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TROQ12816 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TROQ12816 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TROQ12816 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TROQ12816 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
TROQ12816 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TROQ12816 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TROQ12816 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
TROQ12816 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TROQ12816 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TROQ12816 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TROQ12816 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TROQ12816 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TROQ12816 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TROQ12816 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TROQ12816 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TROQ12816 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TROQ12816 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TROQ12816 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TROQ12816 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
TROQ12816 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TROQ12816 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TROQ12816 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TROQ12816 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TROQ12816 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TROQ12816 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TROQ12816 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TROQ12816 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TROQ12816 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TROQ12816 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
TROQ12816 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
TROQ12816 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
TROQ12816 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TROQ12816 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TROQ12816 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TROQ12816 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TROQ12816 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TROQ12816 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TROQ12816 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TROQ12816 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TROQ12816 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms