Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms