Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
IFFO1Q0D2I5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFFO1Q0D2I5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms