Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLEQ07864 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLEQ07864 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLEQ07864 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLEQ07864 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLEQ07864 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLEQ07864 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLEQ07864 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLEQ07864 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLEQ07864 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLEQ07864 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLEQ07864 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
POLEQ07864 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLEQ07864 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLEQ07864 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLEQ07864 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLEQ07864 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLEQ07864 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLEQ07864 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLEQ07864 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLEQ07864 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLEQ07864 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLEQ07864 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLEQ07864 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLEQ07864 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
POLEQ07864 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLEQ07864 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLEQ07864 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLEQ07864 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLEQ07864 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLEQ07864 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLEQ07864 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLEQ07864 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLEQ07864 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLEQ07864 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLEQ07864 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
POLEQ07864 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLEQ07864 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLEQ07864 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLEQ07864 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLEQ07864 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLEQ07864 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
POLEQ07864 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLEQ07864 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLEQ07864 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLEQ07864 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLEQ07864 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLEQ07864 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLEQ07864 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLEQ07864 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLEQ07864 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POLEQ07864 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POLEQ07864 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLEQ07864 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLEQ07864 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLEQ07864 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLEQ07864 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLEQ07864 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLEQ07864 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLEQ07864 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLEQ07864 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLEQ07864 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLEQ07864 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLEQ07864 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLEQ07864 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLEQ07864 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLEQ07864 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLEQ07864 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLEQ07864 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLEQ07864 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLEQ07864 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLEQ07864 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLEQ07864 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLEQ07864 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POLEQ07864 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POLEQ07864 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
POLEQ07864 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
POLEQ07864 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
POLEQ07864 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLEQ07864 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLEQ07864 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLEQ07864 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLEQ07864 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLEQ07864 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLEQ07864 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLEQ07864 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLEQ07864 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLEQ07864 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLEQ07864 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLEQ07864 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLEQ07864 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLEQ07864 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLEQ07864 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLEQ07864 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLEQ07864 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLEQ07864 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLEQ07864 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLEQ07864 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLEQ07864 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLEQ07864 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms