Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COL16A1Q07092 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL16A1Q07092 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms