Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms