Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
TOP2BQ02880 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
TOP2BQ02880 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TOP2BQ02880 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms