Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
GCNT1Q02742 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms