Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms