Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD1P98174 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD1P98174 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD1P98174 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD1P98174 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD1P98174 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD1P98174 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD1P98174 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD1P98174 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD1P98174 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD1P98174 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD1P98174 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD1P98174 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD1P98174 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD1P98174 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD1P98174 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD1P98174 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD1P98174 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD1P98174 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD1P98174 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD1P98174 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FGD1P98174 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD1P98174 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD1P98174 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD1P98174 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD1P98174 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD1P98174 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD1P98174 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD1P98174 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD1P98174 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD1P98174 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD1P98174 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD1P98174 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD1P98174 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD1P98174 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD1P98174 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD1P98174 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD1P98174 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD1P98174 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD1P98174 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD1P98174 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD1P98174 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD1P98174 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD1P98174 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD1P98174 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGD1P98174 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGD1P98174 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGD1P98174 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGD1P98174 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGD1P98174 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGD1P98174 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGD1P98174 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGD1P98174 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGD1P98174 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGD1P98174 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGD1P98174 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FGD1P98174 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGD1P98174 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGD1P98174 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGD1P98174 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGD1P98174 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGD1P98174 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGD1P98174 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGD1P98174 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGD1P98174 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGD1P98174 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGD1P98174 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGD1P98174 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD1P98174 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD1P98174 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD1P98174 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD1P98174 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD1P98174 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD1P98174 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD1P98174 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD1P98174 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD1P98174 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD1P98174 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD1P98174 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD1P98174 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD1P98174 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD1P98174 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD1P98174 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD1P98174 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD1P98174 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD1P98174 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD1P98174 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD1P98174 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD1P98174 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD1P98174 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD1P98174 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD1P98174 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD1P98174 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD1P98174 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD1P98174 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD1P98174 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD1P98174 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGD1P98174 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGD1P98174 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGD1P98174 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms