Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMF1P82094 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMF1P82094 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMF1P82094 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMF1P82094 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMF1P82094 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMF1P82094 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMF1P82094 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMF1P82094 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMF1P82094 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMF1P82094 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMF1P82094 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMF1P82094 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMF1P82094 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMF1P82094 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMF1P82094 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMF1P82094 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMF1P82094 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMF1P82094 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMF1P82094 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TMF1P82094 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMF1P82094 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMF1P82094 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMF1P82094 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMF1P82094 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMF1P82094 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMF1P82094 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMF1P82094 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMF1P82094 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMF1P82094 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMF1P82094 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMF1P82094 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMF1P82094 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMF1P82094 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMF1P82094 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMF1P82094 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TMF1P82094 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TMF1P82094 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TMF1P82094 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMF1P82094 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMF1P82094 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMF1P82094 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMF1P82094 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMF1P82094 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMF1P82094 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMF1P82094 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMF1P82094 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMF1P82094 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMF1P82094 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMF1P82094 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMF1P82094 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMF1P82094 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMF1P82094 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMF1P82094 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMF1P82094 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMF1P82094 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMF1P82094 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMF1P82094 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMF1P82094 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMF1P82094 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMF1P82094 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMF1P82094 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMF1P82094 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMF1P82094 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMF1P82094 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMF1P82094 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMF1P82094 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMF1P82094 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMF1P82094 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMF1P82094 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TMF1P82094 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMF1P82094 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMF1P82094 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMF1P82094 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMF1P82094 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMF1P82094 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMF1P82094 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMF1P82094 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMF1P82094 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMF1P82094 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMF1P82094 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMF1P82094 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMF1P82094 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMF1P82094 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMF1P82094 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMF1P82094 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMF1P82094 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TMF1P82094 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMF1P82094 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TMF1P82094 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMF1P82094 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMF1P82094 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMF1P82094 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TMF1P82094 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TMF1P82094 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TMF1P82094 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TMF1P82094 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TMF1P82094 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TMF1P82094 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TMF1P82094 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms