Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX3P78415 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX3P78415 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX3P78415 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX3P78415 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX3P78415 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX3P78415 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX3P78415 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX3P78415 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX3P78415 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX3P78415 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX3P78415 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX3P78415 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX3P78415 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX3P78415 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX3P78415 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX3P78415 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX3P78415 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX3P78415 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX3P78415 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX3P78415 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX3P78415 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX3P78415 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX3P78415 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX3P78415 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX3P78415 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX3P78415 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX3P78415 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX3P78415 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX3P78415 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX3P78415 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX3P78415 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX3P78415 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX3P78415 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX3P78415 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX3P78415 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX3P78415 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX3P78415 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX3P78415 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX3P78415 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX3P78415 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX3P78415 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX3P78415 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX3P78415 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX3P78415 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX3P78415 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX3P78415 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX3P78415 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX3P78415 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX3P78415 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX3P78415 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX3P78415 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX3P78415 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX3P78415 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX3P78415 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX3P78415 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX3P78415 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX3P78415 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX3P78415 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX3P78415 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX3P78415 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX3P78415 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX3P78415 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX3P78415 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX3P78415 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX3P78415 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX3P78415 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX3P78415 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX3P78415 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX3P78415 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX3P78415 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX3P78415 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX3P78415 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX3P78415 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX3P78415 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX3P78415 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX3P78415 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX3P78415 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX3P78415 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX3P78415 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX3P78415 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX3P78415 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX3P78415 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX3P78415 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX3P78415 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX3P78415 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX3P78415 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX3P78415 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX3P78415 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX3P78415 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX3P78415 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX3P78415 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX3P78415 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX3P78415 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX3P78415 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX3P78415 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX3P78415 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX3P78415 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX3P78415 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX3P78415 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms