Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNA1P78396 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNA1P78396 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms