Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASIC1P78348 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms