Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2IP78347 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms