Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL23P62829 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL23P62829 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL23P62829 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL23P62829 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL23P62829 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL23P62829 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL23P62829 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL23P62829 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL23P62829 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL23P62829 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL23P62829 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL23P62829 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL23P62829 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL23P62829 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL23P62829 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL23P62829 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL23P62829 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL23P62829 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL23P62829 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL23P62829 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RPL23P62829 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL23P62829 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL23P62829 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL23P62829 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL23P62829 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL23P62829 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL23P62829 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL23P62829 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL23P62829 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL23P62829 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL23P62829 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL23P62829 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL23P62829 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL23P62829 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL23P62829 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL23P62829 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL23P62829 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPL23P62829 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPL23P62829 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPL23P62829 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPL23P62829 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RPL23P62829 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPL23P62829 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPL23P62829 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPL23P62829 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPL23P62829 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPL23P62829 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPL23P62829 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RPL23P62829 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPL23P62829 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPL23P62829 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
RPL23P62829 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RPL23P62829 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RPL23P62829 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RPL23P62829 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RPL23P62829 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RPL23P62829 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RPL23P62829 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RPL23P62829 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RPL23P62829 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RPL23P62829 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RPL23P62829 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RPL23P62829 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPL23P62829 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPL23P62829 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPL23P62829 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPL23P62829 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPL23P62829 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPL23P62829 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPL23P62829 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPL23P62829 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPL23P62829 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPL23P62829 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPL23P62829 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPL23P62829 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPL23P62829 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPL23P62829 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPL23P62829 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPL23P62829 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPL23P62829 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPL23P62829 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPL23P62829 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPL23P62829 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPL23P62829 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPL23P62829 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPL23P62829 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPL23P62829 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RPL23P62829 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RPL23P62829 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPL23P62829 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPL23P62829 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPL23P62829 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPL23P62829 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RPL23P62829 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPL23P62829 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPL23P62829 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPL23P62829 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPL23P62829 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPL23P62829 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms