Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HERVK_113P62684 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms