Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPD2P62316 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNRPD2P62316 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNRPD2P62316 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNRPD2P62316 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNRPD2P62316 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNRPD2P62316 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNRPD2P62316 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SNRPD2P62316 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNRPD2P62316 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNRPD2P62316 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNRPD2P62316 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNRPD2P62316 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPD2P62316 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPD2P62316 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPD2P62316 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPD2P62316 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPD2P62316 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPD2P62316 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPD2P62316 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPD2P62316 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPD2P62316 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPD2P62316 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPD2P62316 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPD2P62316 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPD2P62316 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPD2P62316 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPD2P62316 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPD2P62316 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPD2P62316 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPD2P62316 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPD2P62316 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPD2P62316 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPD2P62316 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPD2P62316 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPD2P62316 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms