Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms