Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BRCA2P51587 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms