Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DAP3P51398 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DAP3P51398 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DAP3P51398 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DAP3P51398 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DAP3P51398 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DAP3P51398 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DAP3P51398 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DAP3P51398 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DAP3P51398 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DAP3P51398 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DAP3P51398 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DAP3P51398 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DAP3P51398 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DAP3P51398 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DAP3P51398 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DAP3P51398 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DAP3P51398 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DAP3P51398 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DAP3P51398 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DAP3P51398 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DAP3P51398 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DAP3P51398 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DAP3P51398 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DAP3P51398 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DAP3P51398 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DAP3P51398 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DAP3P51398 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DAP3P51398 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DAP3P51398 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DAP3P51398 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DAP3P51398 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DAP3P51398 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DAP3P51398 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DAP3P51398 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DAP3P51398 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DAP3P51398 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DAP3P51398 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DAP3P51398 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DAP3P51398 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DAP3P51398 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DAP3P51398 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DAP3P51398 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DAP3P51398 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DAP3P51398 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DAP3P51398 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DAP3P51398 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DAP3P51398 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DAP3P51398 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DAP3P51398 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DAP3P51398 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DAP3P51398 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DAP3P51398 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DAP3P51398 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DAP3P51398 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DAP3P51398 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DAP3P51398 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DAP3P51398 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DAP3P51398 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DAP3P51398 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DAP3P51398 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DAP3P51398 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DAP3P51398 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DAP3P51398 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DAP3P51398 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DAP3P51398 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DAP3P51398 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DAP3P51398 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DAP3P51398 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DAP3P51398 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DAP3P51398 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DAP3P51398 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DAP3P51398 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DAP3P51398 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DAP3P51398 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DAP3P51398 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DAP3P51398 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DAP3P51398 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DAP3P51398 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DAP3P51398 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DAP3P51398 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DAP3P51398 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DAP3P51398 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DAP3P51398 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DAP3P51398 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DAP3P51398 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DAP3P51398 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DAP3P51398 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DAP3P51398 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DAP3P51398 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DAP3P51398 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DAP3P51398 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DAP3P51398 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DAP3P51398 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DAP3P51398 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DAP3P51398 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DAP3P51398 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DAP3P51398 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DAP3P51398 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DAP3P51398 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms