Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPT1P50897 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPT1P50897 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPT1P50897 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPT1P50897 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPT1P50897 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPT1P50897 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPT1P50897 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPT1P50897 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPT1P50897 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPT1P50897 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPT1P50897 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPT1P50897 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPT1P50897 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPT1P50897 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPT1P50897 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPT1P50897 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPT1P50897 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPT1P50897 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPT1P50897 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPT1P50897 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPT1P50897 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPT1P50897 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPT1P50897 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PPT1P50897 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPT1P50897 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPT1P50897 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPT1P50897 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PPT1P50897 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPT1P50897 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPT1P50897 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPT1P50897 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPT1P50897 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPT1P50897 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPT1P50897 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPT1P50897 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPT1P50897 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPT1P50897 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PPT1P50897 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPT1P50897 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PPT1P50897 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPT1P50897 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPT1P50897 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPT1P50897 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPT1P50897 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPT1P50897 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPT1P50897 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPT1P50897 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPT1P50897 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPT1P50897 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPT1P50897 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPT1P50897 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPT1P50897 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPT1P50897 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPT1P50897 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PPT1P50897 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPT1P50897 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPT1P50897 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPT1P50897 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPT1P50897 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPT1P50897 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPT1P50897 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPT1P50897 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPT1P50897 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPT1P50897 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPT1P50897 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPT1P50897 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPT1P50897 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPT1P50897 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPT1P50897 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPT1P50897 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPT1P50897 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPT1P50897 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPT1P50897 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPT1P50897 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPT1P50897 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPT1P50897 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPT1P50897 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPT1P50897 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPT1P50897 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPT1P50897 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPT1P50897 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPT1P50897 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PPT1P50897 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPT1P50897 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPT1P50897 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPT1P50897 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPT1P50897 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPT1P50897 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPT1P50897 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPT1P50897 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPT1P50897 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPT1P50897 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPT1P50897 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPT1P50897 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPT1P50897 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPT1P50897 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPT1P50897 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPT1P50897 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPT1P50897 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms